Estado de Referencia: Aguascalientes

Tuve un hijo nacido en USA hace 15 años, lo traje de meses a Mexico y regresamos por tierra asi que ninguna autoridad nos solicito documentos, busque ayuda en la SRE para hacer su estancia legal en Mexico y me respondieron que me tenia que regresar a USA a pedir su acta de nacimiento (si, digale eso a un ilegal que no tiene muchos recursos economicos) mi esposo (qepd)  lo registro como nacido en Mexico cuando ya tenia 3 años para darle imss y mas  tarde pudiera ir a la escuela, pero en Mexico esta registrado con 2 nombres y 2 apellidos (en USA solo 1 nombre y 1 apellido)  ahora quiero arreglar todo ese embrollo legal, nos vamos a vivir a Estados Unidos de forma permanente el proximo año, me volvi a casar con un ciudadano americano. Pude pedir su acta americana por internet, pero ahora como hago para que al salir de Mexico (tramitado su pasaporte americano) las autoridades de Mexico no lo detengan ya que no hay registro de ingreso? o como tramitar su doble nacionalidad si el acta mexicana es diferente en el nombre del niño? el de los padres sigue siendo igual tambien fecha de nacimiento y obvio que dice nacido en mexico. Ayuda por favor