No es delito ni es malo, solo revisa como fue el manejo para que todo quede bien. Lo que parece es que te dieron el dinero para pagar ese comprobante y firmaste un vale (nunca lo dices) por gastos a comprobar, se hizo el gasto, te dieron el comprobante fiscal y perdiste la factura, entonces bastaba con que regresaras el dinero y solicitares tu vale ya que para la empresa no se realizó ningún gasto (para ti sí).

Ahora bien, suponiendo que te dieron el comprobante fiscal del perito para que lo metieras a la empresa y lo pagaran, y tu lo perdiste, ¿Por que habías de pagarle algún dinero a la empresa si ella no ha erogado ningún pago, en todo caso se lo tendrías que pagar al perito y comerte tu pérdida.

En los dos casos te chamaquearon ya que en el primer caso, aún tienen tu vale donde debes ese dinero y en el segundo el perito aún no recibe su dinero y te lo va  a querer cobrar a ti.