Si bien la empresa le tramito un RFC, este fue en la modalidad de empleado y no como Contribuyente del regimen de Persona Fisica. Si ahora desea su RFC para expedir facturas y presentar declaraciones debe inscribirse como tal ante el SAT de acuerdo a la actividad que desempeñara, por ejemplo, prestador de servicios profesionales (honorarios).

Por lo que refiere de los 5 años trabajados en la empresa con su RFC de "empleado", no procede su devolucion puesto que la empresa en sus declaraciones presento la retencion de sus impuestos.

Puede consultar con un Contador Publico al respecto para una mejor atencion a su inquietud.