buen dia; a como se entiende: si solicitaste amparo en contra de la o. de a. y te aprehenden,(por ejemplo el mismo día que solicitaste el amparo, sin haberse llevado a cabo la Audiencia Constitucional) pues no se producen los efectos del amparo, y en cuanto el juzgado de 1a instancia comunique al Juzgado Federal, el juicio se sobresee, debido a que ya no existe el acto reclamado, toda vez que la o. de a. ya fue ejecutada, y próximamente (48-72hrs.)tu situación jurídica cambiará sl dictárse un Auto Consitucional, en el que, por ser delito no grave, puedes obtener la  libertad PROVISIONAL bajo CAUCION,exhibiendo GARANTIA,con la que el proceso penal seguirá hasta dictarte sentencia, etc.

ahora bien, si ya se te concedió la Suspensión definitiva en el juicio de amparo contra o.de a. y te apehenden los polícias, incurre en irresponsabilidad la Autoridad Ministerial, porque cuando se concede la s.d. se comunica a la Autoridad Ejecutora para que se abstenga de detener al sujeto activo hasta en tanto se resuelva el juicio de garantías, de igual forma, al detener al inculpado, la Autoridad Responsable(Juez) debera´comunicarlo de inmediato al Juzgado de Dtto, para que surta los efectos correspondientes y de igual forma se sobresea el juicio, en caso de ser delito grave su proceso quede a cargo del Juzg. de Dtto. (como lo referiste).

en ambos casos, podrá solicitarse otro amparo, pero ahora en contra del Auto de Formal Prisión, en caso de haberse dictado, anque se encuentre bajo fianza.

el juicio de amparo es para combatir un acto reclamado vigente, cuando se ejecuta éste, lo que sigue es sobreseer, debido a que ya no existe.

espero haberme dado a entender, en la humildad de que si me estoy equivocando, alguién más me saque del error.