Le recomiendo primero: preguntar si existe el "reglamento"  escolar en que se pudieren justificar.

segundo: revisar que en dicho "reglamento" se contemple las sanciones que se imponen y las formas que se deben cumplir, como el avisar o no a los tutores en este caso.

tercero: revisar que ese "reglamento" haya sido FIRMADO por el padre o tutor.

Uso las comillas porque me parece necesario aclarar que no he visto (por no afirmar que no hay) disposición LEGAL alguna que obligue a los estudiantes a acudir a la escuela "alineados" como si fuere paramilitar, el aseo personal se entiende por cuestiones de salud, pero el uniforme no es obligatorio ni el tipo de calzado que se puede usar o corte de cabello, etc., lo único en lo que se pueden amparar los directores y maestros de escuela para imponer un uniforme y esas formalidades dignas de un estado militarizado es  en el hecho de que se les muestra a los padres de familia un listado de reglas y al calce se pide la firma DE CONFORMIDAD del padre o tutor; por lo que sería entonces un CONVENIO PARA  REGULAR CONDUCTAS Y FORMALIDADES DE LOS ALUMNOS, mas no un reglamento como lo mencionan, el firmar ese convenio obliga a los padres a ver que los alumnos acudan de tal o cual manera, porque se está buscando la "formación" de los hijos en "disciplina y valores". 

Acudir ante la autoridad educativa es lo más conveniente, para ello hay que generar primero una serie de pruebas que sustenten la petición de revisión o queja que se interponga, ya sea con testigos, grabaciones en video o audio en donde el personal de la escuela prohibe la entrada al alumno.  Luego, continuar con los procedimientos administrativos hasta agotar todos los recursos y llegar al Juicio de Amparo por violentar ese derecho a la educación y a un trato digno, como menciona Primus Tribunus.

Como opinión personal quiero agregar que me parece absurda la exigencia de los uniformes, cabello corto, uñas cortas, etcétera, estoy de acuerdo que la escuela es formativa también, mas no estoy de acuerdo en que la formación que quieren dar es digna de un cuartel militar que solo reprime, castiga, sanciona y provoca que se deserten los niños que luego son catalogados como ninis. Hay personas de saco y corbata que no son formales, como hay personas vestidas a su antojo que tienen más valores y formalidad que muchos...