yo considero que deberas promover dos demandas  diferentes, una ordinaria mercantil en cuanto hace a los pagares prescritos y una demanda ejecutivo mercantil en cuanto hace al o los pagares que no estan prescritos y si hay bienes de por media a embargar con el auto de exequendo que dicte el juez en el ejecutivo mercantil ahi embargas o tambien puedes promover unas diligencias precautorias de embargo para asegurar los bienes y embargarlos antes de promover el ordinario mercantil y asi ya tendras alguna garantia de que se te pagaran las prestaciones reclamadas, espero sirva la informacion.