Asi es solamente, solo se puede configurar el delito de substraccion de menores cuando alguno de los ascendientes (padres, abuelos) que no ejerzan la patria potestad sobre el menor lo substraigan de quien legitimamente tenga la guarda y custodia, lo cual no es tu caso. Si lo que desas es quedarte legalmente con la custodia de tu hija necesitas demandarla ante el juez de lo familiar, pero cabe aclarar que tu debes probar ampliamente que la menor en caso de permanecer bajo la custodia de la madre corre el riesgo de no tener un sano desarrollo fisico y/o psicologico y/o emocional ya que de lo contrario es muy dificil que te la otorguen a ti como padre ya que la ley es muy clara y siempre en este tipo de controversias otorga a la medre la preferencia de la custodia cuando los progenitores se encuentran separados y sobre todo cuando los menores tienen menos de 7 años de edad, a menos que pruebes fehacientemente lo antes mencionado.

Te sugiero que contrates los servicios de un buen abogado en materia familiar el sabra todo el procedimiento a seguir

SUERTE y saludos.