Si Fovissste te otorgo un credito, el es el primero en cobrar en caso de un remate pues el tiene la primera hipoteca, la casa no puede ser rematada o embargada mientras tenga inscrita la hipoteca de fovissste.

Respecto a los pagares tienes que verificar la fecha de vencimiento (si es que la tienen), si el deudor principal ya pago o no, al firmar tu esposa como aval se hace responsable de la deuda, aunque al estar casados por bienes mancomunados solo podria hacer frente con el 50% de sus bienes, pues el otro 50% es tuyo.

De tus preguntas:

1) Una deuda mercantil no impone carcel, por lo que no podria haber orden de aprension contra tu esposa, salvo que la denunciaran por fraude y hay que configurar dicho delito, asi que NO

2) El riesgo que corres al regresar a tu casa es que te esten "molestando" o cobrando en tu domicilio via correo o en persona, ya que el credito con fovissste sigue vigente y tu sigues siendo el deudor para Fovissste

3) En caso de proceder un embargo de bienes muebles la forma de protegerlos es tener todas las facturas, recibos, tickets, etc que acrediten la propiedad y que esten a tu nombre o de tus hijos, para que dado el caso se realice una "terceria excluyente de dominio" y liberes tus bienes.

El prestamo de los pagares con quien fue? un particular o una institucion (banco, casa de empeño)?

Es importante verificar si inscribieron algun gravamen sobre tu propiedad, si pides el "certificado de libertad de gravamen" ademas de la hipoteca de fovissste debe aparecer inscrito el adeudo de los pagares, si no aparece es que no lo han inscrito y por lo tanto la deuda con garantia es hasta ese momento solo en papel, pues no esta registrada.