Bueno, comprendo que no eres abogado, y que por ello es que buscas orientacion,  la emancipación se produce cuando un menor de edad contrae matrimonio o automaticamente cuando cumple la mayoría de edad y practicamente significa el quedar libre de la patria potestad o de la Tutela, aunque como bien mencionas, en el Estado de Jalisco es posible quedar emancipado si se demuestra buena conducta y su aptitud para el manejo de sus intereses, pero no es por maltrato fisico o descuido por parte de sus padres, como tu lo señalas, sino por su buena conducta y capacidad de administración. El mejor concepto es que analices el codigo civil y el codigo de procedimientos civiles para tu estado, ahi encontraras la información que requieres, ya que cada estado tiene sus propias disposiciones. Saludos