Hola seguramente en esto fundamento el policia la infracción, es de la Ley de Caminos, Puentes y Autotrasnporte Federal.

Artículo 74 Bis.  La Secretaría de Seguridad Pública a través de la Policía Federal Preventiva, de conformidad con las disposiciones legales y reglamentarias respectivas, impondrá las siguientes sanciones:

I. Por infracciones a la presente Ley y reglamentos que de ella se deriven en materia de tránsito, multa de hasta doscientos días de salario mínimo, y

II. Cualquier otra infracción a las disposiciones de esta Ley y los ordenamientos que de ella se deriven para la operación de los servicios de autotransporte federal, sus servicios auxiliares y transporte privado cuando circulen en la zona terrestre de las vías generales de comunicación, con multa de hasta quinientos días de salario mínimo.

Esto derivado de que el artículo 6 de dicha Ley dispone que se requiere permiso de la SCT para explotar el autotransporte federal.

Además solo se les da un permiso compplementario para circular pues el Artículo 41señala que se expedirá permiso a los transportistas autorizados por las autoridades estatales o municipales para el uso de caminos de jurisdicción federal que no excedan de 30 kilómetros y sean requeridos para la operación de sus servicios, en los términos del reglamento respectivo.  

Osea que solo para que circulen no para que exploten el autotransporte.