El que no estén juntos, no implica que el padre no quiera reconocerlo.

Si lo consultas y no quiere reconocerlo, entonces tendrás que acudir al a vía judicial a demandar el reconocimiento de paternidad.

Lo tienes que hacer asistida de un abogado especialista en materia familiar, que puede ser particular, defensor de oficio o asignado por parte del DIF de tu localidad.

Tendrá que ofrecerse una prueba pericial en materia de genética, que es cara y tendrás que costearla tú, así que te sugiero que antes de iniciar cualquier acción, trates de que por la buena se haga el reconocimiento por parte del padre y sólo en caso de ser necesario entables la demanda.

Saludos.