Estado de Referencia: Distrito Federal

Hola que tal, espero puedan ayudarme con esto. Actualmente estoy laborando en una empresa, cuento con prestaciones, seguro, etc.  Sin embargo, también llevo proyectos por mi cuenta. Acabo de conseguir un proyecto y el contrato será por 1 año  obteniendo $15,000 mensuales. La empresa me solicita que les facture mes con mes y así ellos podrán pagarme. 

Actualmente estoy dado de alta en hacienda bajo el régimen de "Asalariado", mis preguntas son las siguientes:

• ¿Qué trámites debo de hacer para poder facturarle a la empresa?
• ¿La facturación debe de ser en papel o electrónica?
• ¿Qué gastos puedo deducir?
• ¿En un aproximado, cuánto estaría pagando de impuestos y cuánto iría a mi bolsillo?
• ¿Cuánto me cobraría un contador por realizarme mis declaraciones?

Disculpen si son cosas muy sencillas pero la verdad no tengo idea de cómo funciona esto. De antemano gracias y espero sus respuestas.

Saludos!