Estado de Referencia: Querétaro

Hola:

A fines del mes pasado me despidieron en mi trabajo porque mudan la empresa a otro estado y quiero saber cómo es que debo de proceder ante esta situación ya que me quieren liquidar al 50% porque no cumplí el año con ellos (fueron casi 10 meses), no tuve prestaciones de ley pese a que sabían que necesito una cirugía y además atención con especialista ya que sufro de inflamación crónica del cerebro (ambos problemas de salud son independientes). Durante ese tiempo yo tuve que pagar gastos de consultas, análisis, estudios y medicamentos y nunca me los repusieron y fueron cantidades fuertes para mi economía. En días pasados el contador de la empresa me mandó un cálculo de mi finiquito y liquidación en el que me está descontando ISR (22%) y, según mis cálculos, eso está muy por arriba de lo que deberían descontar según lo que me quieren pagar, además que me dice que lo debe descontar por ley cuando por ley también debieron darme seguro social y no lo hicieron: ¿Cómo puedo proceder para que mi pago sea el total sin ese desproporcionado descuento y de qué manera se maneja lo referente al seguro y a los gastos médicos que tuve que hacer y nunca me repusieron?

Gracias de antemano.