Estado de Referencia: Jalisco

El caso es el siguiente:

Hay un trabajador que se le practico una intervencion para retirarle un tumor maligno cerca del cuello, pero por una negligencia medica le dañaron las cuerdas vucales, no puede hablar y con algunos problemas para respirar, el trabajador ha promovido una queja por supuesta negligencia medica, al principio en marzo del 2012 le expidieron incapacidad por enfermedad general, despues de esa incapacidad no le volvieron a expedir ninguna, y la queja continua, no ha habido conclusion, el patron para el que trabajaba aun sigue pagando sus cuotas, no lo ha dado de baja por esta situacion, pues no le consta que no haya mas incapacidades, mi pregunta es, el patron puede darlo de baja o si lo hace incurre en alguna falta? O que es lo que procede tanto en el caso del patron, como el del trabajador en lo particular?

Muchas gracias anticipadas.