Estado de Referencia: Guanajuato

Buen dia, solicito de favor me orienten en el sentido de que a una compañera dra. la cual se encontraba con un diagnstico psiquiatrico severo y por lo cual se encontraba imposibilitada para acudir a sus labores aunado a que su momento presento una licencia medica expedida por el ISSSTE por 28 dias y en la cual el diagnostico es trastono ansioso-depresivo agudizado, por lo cual los familiares la internaron en una clinica particular en toluca, ademas de que ella trabaja para el IMSS y Secretaria de Salud, los familiares posteriormente le tramitaron las licencias medicas a traves del IMSS, las cuales una vez que la dieron de alta a ella de la clinica acudio al ISSSTE a realizar la solicitud de autorizacion de licencia medica retroactiva y la cual tendra en un periodo maximo de 10 dias, por lo cual en su centro de trabajo su jefe inmediato solicito levantamiento de acta administrativa en la cual argumentan varias figuras juridicas las cuales son: Abandono de Empleo, Faltas Injustificadas, Termino de Nombramiento, Cese y Baja del Trabajador, ademas de que su jefe inmediato declara en el acta administrativa tener el conocimiento de su enfermedad y aun asi determinaron en la resolucion del acta el Cese de la trabajador, mi pregunta es que se puede hacer al respecto?, Gracias