Estado de Referencia: Querétaro

Hola, mi caso es el siguiente, soy el encargado de control de inventarios de un empresa maquiladora que se dedica a hecer uniformes de proteccion personal, hace unas semanas se hizo un conteo fisico y este dio como resultado una gran catidad de faltantes en rollos d tela. Ya he recibido la regañada de mi vida, acto seguido me pidieron investigar todos los consumos de material y ver en donde pudo haber estado el problema que generara todo el faltante, hecho esto me doy cuenta que mis reportes son correctos y no entiendo como es que se dio tanta faltante. Mi jefe directo sospecha que es robo a una escala grande por parte de el personal de vigilanca.

Yo ya estoy fastidiado de la situacion ya que aun no salimos del problema y prefiero presentar mi renuncia a seguir con esto, mi pregunta es ¿que consecuencias legales puedo tener si presento mi renuncia por escrito y una vez presentada dejo de presentarme a trabajar antes de que solucione este problema?

Les agradeceria  su respuesta, esta situacion ya es muy dificil para mi

Nota, el valor estimado de los faltantes es superior a mas de 2 millones de pesos